神经外科周良学教授团队在Molecular Cancer发表研究论文 全面解析颅咽管瘤基因突变特点
近日,我院神经外科周良学教授团队与生物治疗国家重点实验室彭勇教授团队、四川大学生命科学院朱晓峰教授团队合作,在著名期刊Molecular Cancer(IF=27.4)在线发表题为“Characterization of novel CTNNB1 mutation in Craniopharyngioma by whole-genome sequencing”的研究论文。该研究对26例颅咽管瘤(包括16例牙釉质型颅咽管瘤和10例鳞状乳头上皮型颅咽管瘤)及其对应的血液样本进行了全基因组测序分析,全面解析了颅咽管瘤基因突变特点。
颅咽管瘤是一种好发于颅内鞍区及鞍上的少见良性肿瘤。虽然其在组织学上是良性肿瘤,但临床疾病过程常常呈现进行性恶化,目前仍被认为是难治性颅内肿瘤。现有的研究发现CTNNB1基因和BRAFV600E基因分别在牙釉质型和鳞状乳头上皮型颅咽管瘤中高频突变,但是到目前为止对于颅咽管瘤全基因组测序的相关研究仍属空白。
该研究对26对颅咽管瘤样本进行了全基因组测序,平均测序深度为29.51×(肿瘤)和29.75×(血液),共检测到20,772个体细胞突变,SNV和InDels中位数分别为760个和39个,SNV和InDels的平均突变负荷分别为 0.246 bp/M 和 0.013 bp/M,符合良性肿瘤基因突变特征。该研究发现CTNNB1(68.75%)和BRAFV600E(70.00%)在本组样本中仍然分别在牙釉质型和鳞状乳头上皮型颅咽管瘤中高频突变,除此之外还发现FBXW7、SOX2、AHNAK等基因在颅咽管瘤中存在散在突变(图1)。该研究还发现了一种新的CTNNB1突变体,这种突变体同时包含碱基的错义突变和较大片段碱基的缺失。随后的功能实验证明,这种新的突变体具有更强的胞内稳定性,可以通过减低蛋白泛素化水平,抑制β-catenin的降解,从而过度活化Wnt信号通路促进肿瘤的增殖。该研究为进一步全面认识颅咽管瘤的生物学特性提供了理论依据。
博士研究生贺娟、曾真以及助理研究员王跃龙为该文章共同第一作者,四川大学华西医院神经外科周良学教授、四川大学华西生物治疗国家重点实验室彭勇教授以及四川大学生命科学院朱晓峰教授为共同通讯作者。
原文链接:https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-021-01468-7