pacBio公司近日宣布新品——HiFiViral SARS-CoV-2 Kit。这是一种可用于监测COVID-19的整体解决方案,可以帮助公共卫生实验室鉴定新型的SARS-CoV-2变异株,并检测在人群中传播的所有变异株。

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)突变迅速,但这种新的解决方案让实验室能够实时监测病原体的进化。与需要定期更新且重新验证的扩增子分析不同,新的HiFiViral SARS-CoV-2 Kit让研究人员能够更全面地了解所有突变,确保新出现的变异株可及时捕获到,以供进一步研究。

这种解决方案采用准确可靠的HiFi测序来检测SARS-CoV-2变异。与短读长测序相比,HiFi测序带来了一幅更全面的视图,包含所有类型的病毒变异,并让实验室能够识别多种病毒突变,包括每个样本中可能出现的低频变异。

目前,基于扩增子的病原体监测技术限制了实验室实时识别新的SARS-CoV-2突变。一些突变会影响引物结合,这对目前的临床检测模式提出了挑战。这种局限性可能会妨碍人们鉴定新的变异并了解它们在人群中的传播。若没有监测,公共卫生决策者将无法看到新出现的突变,这可能会延长响应时间。

HiFiViral SARS-CoV-2 Kit使用分子倒置探针实现了经济高效的病毒测序,通过简化工作流程和提供突变弹性来解决基于扩增子的解决方案的常见挑战。与SMRT Link v10.2软件配合使用,完整的解决方案让实验室能够对实验进行质量检查,并生成文件进行监控。自动化的测序和分析流程可以一键启动,并在一夜之间完成。

与此同时,pacBio还升级了微生物全基因组组装的流程。它宣布推出新的实验方案、分析软件以及SMRTbell Barcoded Adapter plate 3.0,将HiFi测序的强大功能应用到微生物全基因组组装中。

新的解决方案有以下特点:

96个带条形码的接头,改进了多重分析的设计

通量提高,每次运行的样品数量从48个增加到96个

通过更高的多重分析降低了每个样品的成本

SMRTLink v10.2应用程序可快速组装参考级别的基因组

pacBio表示,这些工具可用于调查食品供应中的病原体,追踪抗生素耐药性,并鉴定新出现的病原体威胁。与新的HiFiViral SARS-CoV-2 Kit搭配使用,这些创新为公共卫生和微生物研究实验室提供了强大的选择,他们可通过Sequel II和Sequel IIe系统为广泛的用户提供服务。

HiFiViral SARS-CoV-2 Kit目前已开始发售。HiFi微生物全基因组组装应用的组件将于本季度上市。