根据7月15日发表在《自然微生物学》(Nature Microbiology)杂志上的一项研究，国家地图集将告诉科学家李斯特菌和其他相关物种在美国的周边地区居住的地方，这可能有助于科学家追踪和确定在配料、食品加工设施和成品中发现的李斯特菌的来源。

“当我们试图找出风险的李斯特菌从土壤和不同的位置,我们的团队创造了一个更系统化的方法来评估频率不同的李斯特菌在不同的位置,”农业和生命科学学院食品安全和食品科学教授Martin Wiedmann说。“我们研究了纽约、科罗拉多和加利福尼亚等不同地区的李斯特菌，但在这张地图集之前，很难比较和评估不同地区的李斯特菌多样性。”

食物中的单核细胞李斯特菌会使人极度生病。美国疾病控制与预防中心(CDC)估计，美国每年有1600人感染李斯特菌病;其中大约有260人死亡。

知道李斯特菌自然存在于土壤中后，康奈尔大学的研究小组请全国各地的数百名科学家从自然界中一般未受干扰的地方采集土壤样本，比如州公园和国家公园的小径外区域。

从这些样本中，该小组开发了一个全国范围内的1854个李斯特菌分离株图集，代表了被称为系统群的细菌的12个科和594个菌株。

该论文的第一作者Jingqiu Liao曾在Wiedmann的实验室攻读研究生，现在是哥伦比亚大学(Columbia University)的博士后研究员。她通过在自己的旅行中获取土壤样本补充了研究，发现李斯特菌存在于各种环境环境中。这种细菌主要受土壤湿度、盐分浓度和钼的控制。钼是一种存在于牛奶、奶酪、谷物、豆类、多叶蔬菜和器官肉类中的微量元素。

“这项工作的目标是系统地收集美国各地的土壤样本，”Liao说，“并捕捉自然环境中李斯特菌物种的大规模空间分布、基因组多样性和种群结构。”

“通过全基因组测序和全面的群体基因组分析，”Liao说，“我们为细菌基因组灵活性的生态和进化驱动因素提供了答案——这是微生物学领域一个重要的开放问题。”

Liao解释说，这项工作可以作为未来人群基因组学研究的参考，并可能通过定位可能有自然来源的李斯特菌污染而使食品工业受益。

Jingqiu Liao, Xiaodong Guo, Daniel L. Weller, Shaul pollak, Daniel H. Buckley, Martin Wiedmann, Otto X. Cordero. Nationwide genomic atlas of soil-dwelling Listeria reveals effects of selection and population ecology on pangenome evolution. Nature Microbiology, 2021; 6 (8): 1021 DOI: 10.1038/s41564-021-00935-7