新型基因编辑系统IntMEMOIR追踪细胞谱系
2021-04-12 00:00:00
来源:网络整理
根据一项新的研究,研究人员利用一种新的基因编辑系统intmemori,揭示了单个细胞在其原始组织背景下的细胞谱系历史。这种新方法为在不同的细胞系统中记录细胞谱系提供了强有力的新工具。
在多细胞发育过程中,细胞的空间位置和谱系对细胞命运的决定起着重要的作用。直接在它们的原生组织中可视化血统关系的能力可以为影响发育和疾病的因素提供有价值的见解。这一前景刺激了一些工程细胞谱系记录系统的发展。然而,目前用于追踪细胞谱系的许多技术需要测序,这会破坏空间组织,或者需要防止扩展记录和种系传播的方法。在这里,Ke-Huan Chow和他的同事介绍了intMEMOIR,这是一个广泛使用的数字谱系记录系统,它允许工程细胞以一种可以在原位读出的格式记录谱系。
intMEMOIR使用基于整合酶的合成条形码系统对细胞遗传密码的目标区域进行不可逆的核苷酸编辑。利用单分子荧光原位杂交技术可以在一个细胞群体中读取各种不同的改变组合,从而可以同时分析细胞在其原组织中的谱系和转录状态。Chow等人通过重建小鼠胚胎干细胞的谱系历史证明了这一新方法。更重要的是,作者利用intMEMOIR将果蝇大脑中的细胞谱系、细胞命运和空间结构联系起来。
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