全基因组CRISPR筛查揭示了SARS-CoV-2感染的关键宿主因子
耶鲁大学、麻省理工学院和哈佛大学的研究人员对暴露于COVID-19和MERS病毒的数亿细胞进行了筛选,确定了数十种既能使病毒在细胞中复制,也能使病毒似乎对病毒关上大门的基因。
研究人员说,这些基因的预防病毒和抗病毒作用将有助于指导科学家开发新的治疗方法来对抗COVID-19。这项发现发表在10月26日的《Cell》杂志上。
科学家们先前已经确定了导致COVID-19的SARS-CoV-2冠状病毒是如何附着和侵入细胞的,但对于为什么一些细胞更容易受到感染知之甚少。了解宿主细胞易受感染的遗传因素可能有助于解释为什么有些人接触病毒后症状很少或根本没有,而另一些人却病入膏肓或死亡。
在这项研究中,研究人员对一系列绿猴子细胞进行了全基因组筛选,这些细胞在接触SARS-CoV-2后比通常使用的人类细胞系更容易死亡。筛选首次允许研究人员同时追踪病毒和细胞的相互作用。这些筛查证实了早先的发现,编码细胞表面受体的ACE-2基因促进了SARS-CoV-2的感染。
然而,筛选还发现了两种新的病毒蛋白复合物和第三类似乎有助于预防感染。他们发现开关基因的SWI/SNF复合物和具有多种功能(包括调节炎症)的HMGB1与感染后细胞死亡增加有关。
研究人员随后引入了小分子药物,这些药物可以抑制两种已鉴定的基因产物的功能,并发现它们可以提高培养皿中感染后细胞的存活率。
相比之下,组蛋白H3复合物,帮助调节细胞核内基因的表达,似乎提供了一种保护作用,抑制SARS-CoV-2感染和杀死细胞的能力。
耶鲁大学实验室医学和免疫生物学助理教授、论文的通讯作者Craig Wilen说:“了解对COVID-19反应的广泛变化是非常重要的,例如,为什么老年人更容易死亡。我们已经确定了预防病毒基因和抗病毒基因,这些基因可能有助于我们预测谁可能患上重病,以及什么样的药物对治疗病人有帮助或有害。”
Wilen指出,这些信息不仅有助于当前的大流行,而且有助于为未来新出现的冠状病毒的爆发做好准备。
原文检索:Genome-wide CRISpR screens reveal host factors critical for SARS-CoV-2 infection
(生物通:伍松)