用独特的DNA条形码编程的合成孢子提供了可用于标记和跟踪物体出处的高度灵活的高分辨率系统。在一则新的报告中,研究人员介绍了他们的新方法—带条形码的微生物孢子(BMS)系统—它在识别食源性疾病的源头方面可能特别有用。

快速、准确地确定目标对象出处的能力在追踪蔬菜的耕作源头或确认假冒产品制造等应用中至关重要。当前的标记技术通常劳动强度大且易遭破坏,尤其是考虑到复杂的全球供应链问题。鉴于天然微生物的普遍存在、它们独特的种群以及实体对象会接纳其环境中独特微生物构成的能力,用某目标物微生物特征来确定其来源或能为标准的标记手段提供一种替代方法。

但它也面临着各种各样的挑战,包括需要进行广泛而昂贵的环境绘测。Qian和同事在这此提出了一种新方法,它用基因工程改造的微生物作为耐久性分子标记。Qian等人创制了含有独特DNA“条码”序列的不能存活的枯草芽孢杆菌株和酿酒酵母菌株;这些条码序列可用多种工具快速识别,其中包括SHERLOCK(这是一种基于CRISpR的新型便携式DNA检测装置)。

当散布在物体上或环境中时,BMS可以在多种表面上持续数月,而标记的孢子可被转移到与其接触的其它物体上。Qian等人证明,该系统特别适用于确定食品来源及快速追踪食品污染源。即使在洗涤和烹煮后,标有DNA条形码的苏云金芽孢杆菌(B. thuringiensis)仍可在标记的农产品上被检测到。Jeff Nevala在相关的《视角》文章中对该方法进行了更详细的讨论。