2018年5月29日，国际著名期刊《Nature communications》在线发表了中国科学院生物物理研究所周政课题组与美国克利夫兰Lerner Research Institute 的Zihua Gong课题组合作完成的研究论文“Structural basis for recognition of 53Bp1 tandem Tudor domain by TIRR”。 该项研究首次详尽揭露TIRR抑制53Bp1识别组蛋白修饰H4K20me2的分子机制，对进一步了解细胞的DSB修复通路具有重要意义。

真核细胞中对于DSB（DNA Double Strand Break）有两种主要的修复方式：非同源末端连接（NHEJ，non-homologous end-joining），以及同源重组（HR，homologous recombination）。两种不同的DSB修复途径各在不同的细胞周期中发挥作用，从而确保基因组遗传物质的稳定。53Bp1蛋白是NHEJ途径中的重要上游调控因子，它通过其串联Tudor结构域识别损伤染色质上H4K20me2修饰，从而被招募至染色质上发挥其招募下游效应因子的重要功能，进而影响整个NHEJ修复途径。

而TIRR是新鉴定出来的目前唯一一个天然的组蛋白甲基化reader抑制蛋白，它能够和53Bp1的串联Tudor结构域直接相互作用，阻断其Tudor结构域对H4K20me2的识别，从而抑制53Bp1 被招募至染色质上发挥下游功能。这也是细胞针对DSB修复通路的一种重要调控方式。但由于结构信息的缺乏，TIRR是如何调控53Bp1并抑制其被招募至染色质上的，这一过程并不清楚。

在这项研究中，研究人员解析了TIRR/53Bp1 Tudor复合物的1.76-埃分辨率晶体结构。结构显示TIRR通过其N端区域以及关键的L8 loop结合并占据53Bp1的Tudor结构域，诱导Tudor结构域上用于阅读H4K20me2分子标记的芳香笼结构发生了明显的构象改变，从而失去了对H4K20me2的识别能力。

此外，通过生物化学、生物物理学、细胞生物学等多种方法说明结构中发现的关键氨基酸在TIRR/53Bp1相互作用中具有重要影响。通过对TIRR的氨基酸序列进行分析，研究人员还发现位于L8 loop上的His106是TIRR在进化过程中获得的一个独特的氨基酸，并且其对于TIRR调控53Bp1十分重要。

最后，通过结构指导的定点突变方法还筛选出了相对于野生型TIRR对53Bp1具有更强结合能力的TIRR突变体，对Tudor结构域等组蛋白甲基化reader蛋白的小分子药物设计具有重要的指导意义。

该项工作由中国科学院生物物理研究所周政课题组与美国克利夫兰Lerner Research Institute 的Zihua Gong课题组合作完成。中科院生物物理所周政研究员和Lerner Research Institute的Zihua Gong研究员为本文的共同通讯作者。周政课题组博士研究生戴亚鑫、Zihua Gong课题组助理研究员Aili Zhang、周政课题组副研究员单珊为文章的共同第一作者。该研究获得国家自然科学基金、科技部973计划、中国科学院战略性先导科技专项（B类）等资助。生物物理所表观遗传团队的其余成员在研究过程中提供了重要帮助。

原文标题：

Structural basis for recognition of 53Bp1 tandem Tudor domain by TIRR