提高表观遗传时钟的可靠性
表观遗传时钟是基于DNA甲基化的强大生物标志物,用于跟踪人口研究、临床试验和个人健康应用。为了测量生物年龄,它们强烈地预测了与年龄相关的发病率和死亡率以及健康的其他方面。现在,耶鲁医学院的科学家们与国际研究同事合作,开发了一种新的方法,使它们大大提高了可靠性。
这项发表在《自然衰老》(Nature Aging)杂志上的研究表明,使用之前开发的时钟来估计一个人的表观遗传年龄,如果从同一个血液样本中估计两次或两次以上的测量(称为技术重复),往往会相差多达9年。这种噪音限制了表观遗传时钟的效用,尤其是在跟踪这些测量值随时间变化的纵向研究中。
然而,耶鲁医学Morgan Levine博士实验室的一种新方法能够几乎完全减少这种差异。医学博士、精神病学助理教授、论文第一作者Albert Higgins-Chen说,新的计算方法可以用来隔离和消除旨在预测衰老和死亡的生化测试中的“技术噪音”。
Higgins-Chen说:“相对而言,很少有人关注表观遗传时钟的测试重测可靠性。我们发现,表观遗传时钟可以在一次测试中显示你的生理年龄为50岁,而在下一次测试中显示你的生理年龄为59岁。我们从现有的、常用的时钟开始研究,发现一个简单的改变——加入一种叫做主成分分析的技术——就可以在显著降低噪声的同时保留老化的信号。现在,对于大多数测试来说,同时进行的两次测量结果相差不到一年。这也意味着,一个人的纵向时钟变化更有可能反映真实的生物衰老,而不是技术噪音。”
这些发现对从流行病学研究到临床试验的应用都有重大意义。这些新开发的表观遗传时钟与传统时钟类似,可以预测疾病和衰老的结果,但在纵向跟踪时,它们也显示出更稳定的轨迹。该团队进一步证明,当表观遗传时钟被用作临床终点时,使用新的表观遗传时钟版本可以大大减少干预测试和临床试验的样本量需求。
虽然表观遗传时钟显示出很多作为衰老的生物标记物的希望,但如果我们想有一天用它们来测试对衰老和疾病的干预,我们需要继续努力使这些措施更可靠和有效。
耶鲁大学提供