历史上的病毒感染可以在脊椎动物基因组中追溯到。数百万年来,这些基因组一直是逆转录病毒的知识库,它们将它们的代码整合到生殖细胞中,并作为内源性逆转录病毒(ERVs)遗传下来。来自乌普萨拉大学的研究人员现在提供了在考拉基因组中建立逆转录病毒的新发现。这项研究结果发表在《美国国家科学院院刊》上。

研究人员检查了考拉的基因组,发现了新的ERV谱系,除了先前已知的考拉逆转录病毒(KoRV)。KoRV与考拉的疾病(如癌症)有关,并正在成为种群中的erv。这使得考拉被视为实时建立逆转录病毒及其健康影响的潜在模型,这种可能性现在被新的ERV谱系的意外分布模式加强了。

“通过筛选考拉的基因组,我们已经确定了新的ERV谱系。其中一种与松鼠猴逆转录病毒有关,这种病毒通常在南美洲/中美洲发现。这种类型的许多erv只在少数考拉个体中发现,这表明它们是相对较新的。这项研究的主要作者梅特·莉莉(Mette Lillie)说:“它甚至可能表明在人口中存在一种持续的存在。”

对物种群体的全基因组进行大规模测序,使研究人员能够将新型erv和目前正在形成的逆转录病毒(如KoRV)进行比较。根据ERV在种群中的分布模式和ERV谱系差异的比较,研究人员得出结论,可能在考拉和其他共享相同环境的动物物种中发现额外的活性逆转录病毒。这些观察结果是在澳大利亚动物群中寻找潜在的活性逆转录病毒的推动力,这些病毒尚未被确定。

“过去逆转录病毒感染后留下的erv现在使揭示逆转录病毒和动物物种之间的历史相互作用成为可能,例如绘制病毒传播是如何发生的。ERV分布模式在宿主种群中的变化也可以作为基因组标记,例如在濒危物种的管理和保护方面,”该研究的负责人patric Jern说。

原文标题:

Expansion of a retrovirus lineage in the koala genome