天堂鸟类基因组针对性选择
一项新的研究发表在开放获取期刊GigaScience上探索一组迷人的鸟类,天堂鸟类的基因组,提供来自5种天堂鸟类的基因组序列:3种没有可用的基因组序列。天堂鸟,精心制作的五彩缤纷的羽毛以及复杂的求爱表演,在自然历史中占有特殊的地位。它们是性选择的学校书籍的例子,这是具有“吸引力”特征的几代男性选择男性选择的结果。结果是无与伦比的物种辐射,其中雄性表现出极端的形态特征和行为,没有其它进化意义,而不是吸引雌性进行交配。然而,人们对遗传变异知之甚少,这些遗传变种将奢华的天堂鸟与不那么显眼的亲戚区分开来,如带领的捕蝇器。多种物种的全基因组可用性为分子进化提供了丰富的资源,以识别受性选择影响的基因,以及评估这些基因如何将雄性羽毛转化为丰富资产以进行交配的方法。
着名的进化生物学家恩斯特·迈尔(Ernst Mayr,1904-2005)曾经说过天堂鸟:“每个鸟类学家和观鸟者都有他最喜欢的鸟类。坦率地说,我自己是天堂鸟和鸟类。如果他们不排名他们应得的全球知名度很高,只是因为人们对它们了解甚少。“
瑞典自然历史博物馆的研究人员,美国科学家以及法兰克福Senckenberg博物馆的第一作者Stefan prost承担了解决这些外来鸟类可获得的有限信息的任务。他们选择了三种尚无可用基因组序列的物种:来自印度尼西亚欧比岛的天堂乌鸦(Lycocorax pyrrhopterus);来自澳大利亚新南威尔士州的天堂riflebird(ptiloris paradiseus);来自巴布亚新几内亚的huon astrapia(Astrapia rothschildi)。他们进一步提供了新的基因组序列数据,以改善巴布亚新几内亚其他两种天堂鸟类的现有基因组信息:萨克森国王天堂鸟类(pteridophora alberti)和红色的天堂鸟(paradisaea rubra)。
瑞典自然历史博物馆的高级策展人Martin Irestedt说:“天堂之鸟是性选择如何推动男性羽毛装饰和交配行为向极端发展的最着名的例子之一。因此非常令人兴奋的是,我们能够提供基因组数据,这些数据提供了基因组进化如何与这个迷人的鸟群中发现的非凡表型变异相关联的第一眼。“
使用这五个天堂鸟类数据集,prost及其同事确定了显示过去选择和进化影响迹象的基因,其中一些似乎对着色,形态,羽毛和眼睛发育很重要。例如,他们发现了一种名为ADAMTS20的基因,它可能参与制作精致的天堂鸟类彩色羽毛。已知ADAMTS20影响黑素细胞的发育,黑素细胞是用于产生色素沉着模式的特化细胞。
由于现代基因组学以及GigaScience数据库GigaDB中这些新数据集的可用性,我们即将学习更多有关这些迷人动物的信息。