m6A调控因子与m6A相关基因在肝癌中的整合分析
在BIO Integration杂志上发表一篇新的文章讨论了m6A调控因子和m6A相关基因在肝细胞癌(HCC)中的整合分析。
真核生物mRNA的n6 -甲基腺苷(m6A) RNA甲基化参与了多种肿瘤的进展。本研究通过整合生物信息学分析,综合分析了m6A调控因子和m6A相关基因,包括表达、聚类、蛋白-蛋白相互作用、预后等,为m6A调控因子和m6A相关基因在HCC中的作用提供了新的视角。
研究共获得192个m6A相关候选基因和3个m6A调控因子,包括YTHDF1、YTHDF2和YTHDC1。这些基因和调控因子在HCC不同分期的表达差异显著。
研究人员通过Cox回归分析,获得98个m6a相关预后基因中的19个,构建风险评分模型。HCC患者1年和3年曲线下面积(AUCs)均大于0.7。通过分析高、低危险评分组的突变差异,作者确定Tp53在高危HCC患者组突变频率最高,而titin (TTN)在低危险HCC患者组突变频率最高。
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文章参考文献:
Jingdun Xie, Zhenhua Qi, Xiaolin Luo, Fang Yan, Wei Xing, Weian Zeng, Dongtai Chen and Qiang Li, Integration Analysis of m6A Regulators and m6A-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma. BIO Integration, 2021, https://doi.org/10.15212/bioi-2021-0002
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