在罕见的衰老疾病中起作用的四链DNA结构
除了经典的双螺旋结构外,研究人员最近还发现了一系列其他的DNA链结构,包括四螺旋DNA,它形成了被称为G-四链体(G-quadruplexes, G4s)的结构。
虽然许多新的DNA结构只在培养皿中的细胞中观察到,但最近在活的人类细胞中观察到G-四链体。然而,它们在细胞中可能的功能尚未被发现。
现在,伦敦帝国理工学院分子科学研究中心的研究人员观察到一种被称为CSB的蛋白质优先与一种特定类型的G-四链体相互作用。当DNA的遥远部分相互作用时,这些特殊的G-四链体就出现了,而研究人员认为这种情况是不可能在细胞内形成的。
正常功能的CSB蛋白不会造成任何不良影响,但产生CSB蛋白的基因突变会导致致命的过早衰老障碍科凯恩综合症,许多患者在成年之前就死于这种疾病。
研究小组发现,导致可卡因综合症的CSB蛋白突变不再能够与远程g-四联体相互作用。虽然我们还不知道为什么会这样,但该团队今天发表在《美国化学学会杂志》上的研究结果表明,这些长程DNA G-四链体与CSB的功能角色特别相关。
来自帝国理工学院化学系的首席研究员马可·迪·安东尼奥博士说:“我们的基因组DNA有两米多长,但被压缩到直径只有几微米的空间里。因此,在比我们想象的更复杂的相互作用中,长环结构被利用来压缩DNA的方式也就不足为奇了。
“关于DNA,我们仍有很多不了解的地方,但我们的结果表明,G-四链体结构的形成是如何以及在哪里影响其功能的,这使它们在生物学上比之前认为的更重要。”
DNA链非常长,并且缠绕在紧密的结构中以适应我们的细胞。此前,研究人员曾假设g -四重体仅从相邻的DNA区域形成。然而,研究小组发现g四重体是由DNA链的不同部分组成的,它们之间的空间距离不同。
正是这些G-四链体特异地与CSB蛋白相互作用。研究小组表明,CSB可能会利用g四联体将DNA的远端部分连接起来。
这种相互作用的确切结果还有待确定,但之前的独立研究发现,没有CSB的细胞在处理具有形成G-四链体潜力的序列周围的DNA时存在困难。
帝国理工学院的研究小组现在发现,引起可卡因综合症的CSB突变形式特别吸引连接遥远DNA部分的G-四链体。这可能意味着对突变CSB基因的进一步研究可能揭示这些远程DNA结构的特定生物学功能。
接下来,研究人员想要将G-四链体和功能性CSB基因结合在一起,以确定它们之间的关系:CSB是否帮助G-四链体将两个遥远的DNA区域连接在一起,或者CSB是否在g -四重体完成其功能后启动它们的分裂,或者两者结合。
该研究的第一作者,来自帝国理工学院化学系的Denise Liano说:“目前还没有治愈可卡因综合症的方法。但随着对G-四链体和可卡因综合症背后基因相互作用的进一步研究,我们可以了解到有望让我们发现治疗工具的细节,比如可以调节相互作用并对抗疾病引起的过早衰老的设计分子。”
Journal Reference:
Denise Liano, Souroprobho Chowdhury, Marco Di Antonio. Cockayne Syndrome B protein Selectively Resolves and Interact with Intermolecular DNA G-Quadruplex Structures. Journal of the American Chemical Society, 2021; DOI: 10.1021/jacs.1c10745