川大华西医院呼吸与危重症医学科与胸外科在Nature Communications发表研究论文,揭示肺腺癌演进的细胞及分子特征
11月11日,我院呼吸与危重症医学科李为民教授与胸外科车国卫教授团队在Nature Communications(IF= 14.919)在线发表了题为“Deciphering cell lineage specification of human lung adenocarcinoma with single-cell RNA sequencing”的研究论文,揭示肺腺癌演进的细胞及分子特征。
我院李为民教授和车国卫教授为论文共同通讯作者,四川大学华西医院为论文第一单位,我院呼吸健康研究所汪周峰、胸外科周坤、呼吸与危重症医学科王成弟博士为论文共同第一作者。该研究得到了国家自然科学基金委重点、面上和青年项目等经费的资助。
肺癌是全球头号癌症杀手,其中肺腺癌是肺癌中最常见的病理类型。肺腺癌演进历经基因突变、分子表达异常、非典型增生(AAH)、原位癌(AIS)、微浸润癌(MIA)及浸润癌(IA)的多阶段发展过程,这一过程可能要经历5-20年时间。在临床上,前驱病变(AAH和AIS)可能不需要积极干预,一旦发展为浸润性腺癌,恶性程度明显增强,需要及时干预。所以在肺腺癌进展为浸润腺癌之前,如果我们能够及时发现并干预,将很大程度上提高患者的5年生存率。
先前对腺癌演进的研究主要是对基因突变特征的分析,对演进背后的细胞异质性和分子事件仍不清楚。本研究聚焦肺腺癌演进不同病理阶段,纳入AAH,AIS,MIA及IA四个阶段的25例患者,获得268,471 个细胞进行单细胞 RNA 测序,结果鉴定了16个细胞亚群。
对不同病理阶段肿瘤细胞分析,发现一群与 2 型肺泡细胞 (AT2) 非常相似的五个细胞亚群(AT2-like细胞),其中AT2-like 2亚群为早期肿瘤细胞亚群。这些细胞在非典型增生期间开始出现,随着 LUAD 的进展,其转录谱开始与 AT2 细胞的转录谱不同。拟时序分析发现肿瘤细胞基因表达随着肿瘤进展具有连续性,即随着肿瘤演进,肿瘤细胞由正常的AT2细胞(SFTpC,SFTpA),逐渐出现去分化,同时细胞表现出干性样特征(CD44, IFI27和S100A4);肿瘤细胞代谢和EMT作用增强,最终促进肿瘤细胞侵袭和转移。进一步证实MDK和TIMp1基因随着肺腺癌进展表达逐渐升高,是 LUAD 演进的关键分子。对肿瘤微环境分析发现,肿瘤相关成纤维细胞在AAH和AIS阶段便开始出现,产生影响肿瘤血管生成、免疫和代谢的分泌因子;随着肿瘤进展NK细胞的比例逐渐减小,耗竭性T淋巴细胞逐渐增加,免疫细胞逐渐由免疫激活状态转变为免疫抑制状态,从而参与肺腺癌的演进。该研究阐明了LUAD演进肿瘤细胞的转录特征,为肺癌早期诊断和早期治疗提供了新的策略。