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2017年中国潜水器“蛟龙号”降落西太平洋雅普海沟采集了两条鱼,这两条鱼生活在距离水面6903米的深处,属于以前未知的物种。

这种鱼有额外的基因来修复它的DNA,并制造一种稳定必需蛋白质的化学物质。它也失去了许多支撑嗅觉的基因,也许是因为它的食谱有限。

由于这一新物种是在海平面以下6000米处的哈达尔区发现的,因此它暂时被称为雅普哈达尔狮子鱼(Yap hadal snailfish)。在这样的深度,没有阳光,水很冷,食物匮乏,压力很大。其成员生活在很大的深度范围内。这些狮子鱼看起来有点像蝌蚪,而且没有鳞片:它们的身体像水母。

为了弄清狮子鱼是如何生存的,中国福建农林大学陈新华领导的研究人员现在已经对其基因组进行了测序。

他们发现,狮子鱼的基因组中有与DNA修复相关的额外基因拷贝,包括一个名为rad51的基因的8个拷贝。一些DNA修复基因也包含突变,这些突变会改变它们编码的蛋白质——尽管目前还不清楚这是不是或如何有助于深海生活。

这种鱼还拥有五个被称为fmo3的基因拷贝,fmo3对三甲胺N-氧化物(TMAO)的产生至关重要:TMAO是一种稳定蛋白质的化学物质,可以保护蛋白质免受高压的破坏。与此相比较,狮子鱼的肌肉组织中TMAO水平升高,而生活在较浅水域的斑马鱼则高。

雅普哈达尔狮子鱼失去了许多嗅觉受体基因,表明嗅觉有限。陈说,这可能是因为它有一个重复的饮食——狮子鱼的胃只充满一种甲壳类动物。奇怪的是,它有额外的酸味受体基因,而且还不清楚为什么。

陈和他的团队还探索了雅普哈达尔狮子鱼的起源。他们将其基因组与生活在东北数百公里的2019年测序的马里亚纳海沟的马里亚纳海沟狮子鱼进行了比较。

这两种狮子鱼被证明是密切相关的。陈说,它们生活的两条海沟形成于800万至1000万年前,因此可能是祖先的狮子鱼找到了进入这两条海沟的途径,并随后独立进化。导致这两个海沟的孤立,它们有不同的深度和环境条件。

原文参考:pLoS Genetics,DOI:10.1371/Journal.pgen.1009530