SARS-CoV-2转录组ApOBEC RNA编辑模型

根据一项新研究，两种人类脱氨酶在SARS-CoV-2病毒进入患者体内时编辑其RNA，对病毒的进化和感染的传播有意义。

这一发现为理解RNA编辑如何影响SARS-CoV-2的复制提供了第一步——这是一个潜在的重要过程，因为宿主被感染后，病毒基因组在体内的编辑可能影响了包括风疹在内的其他病毒的进化。

Salvatore Di Giorgio和他的同事们注意到，通过比较SARS-CoV-2基因组中被编辑的位点和那些被突变的位点，科学家们可能找到靶向病毒的新策略。

哺乳动物表达两个不同的脱氨酶家族——ADARs和ApOBECs，它们通过从核碱基成分中去除一个氨基来改变病毒RNA（或者DNA中间产物）的基本核苷酸结构单元。然而，目前还不清楚这种天然的病毒抵制过程是否对冠状病毒起作用。

为了评估RNA编辑是否与机体对SARS-CoV-2感染的反应有关，Di Giorgio等人分析了从COVID-19确诊患者肺泡灌洗液中提取的RNA序列数据中的单核苷酸变异。虽然他们观察到了少量的突变事件，但研究人员确实发现了可能归因于RNA编辑的核苷酸变化（腺苷到肌苷的变化来自ADAR脱氨酶，胞嘧啶到尿嘧啶的变化来自ApOBEC）。为了更好地了解RNA编辑是否是进化过程中获得突变的原因，研究人员还比较了SARS-CoV-2、MERS-CoV和SARS-CoV的基因组突变。他们认为这些冠状病毒株中有相当比例的突变可能是由脱氨酶引起的。作者推测，如果这些酶确实参与了人类抵制SARS-CoV-2感染的反应，那么一种影响两种形式ApOBEC的遗传变异（在中国人群中很常见）也许可以解释在中国流行的SARS-CoV-2的遗传多样性。

原文检索：Evidence for host-dependent RNA editing in the transcriptome of SARS-CoV-2

（生物通：伍松）