pacBio已经开始在全球范围内与客户紧密合作，以帮助对抗COVID-19大流行。商业、学术和政府研究团队的科学家正在使用高度精确的SMRT测序数据来解析个体或整个患者群体中可能存在的SARS-CoV-2病毒变异。这对于开发和优化有效的诊断方法，疫苗和治疗药物的研发都至关重要。

很多与COVID-19相关的研究工作都使用到了pacBio HiFi测序，因为这是目前唯一一种能够兼顾长读长和高准确度的测序技术。这样的数据非常适合诸如病毒测序之类的应用，因为对新型冠状病毒的测序要求能够区分在病毒基因内部或整个病毒基因组中仅有的少数单核苷酸变异（SNV）。


pacBio HiFi Reads 在读取长度（20-25 kb）和准确度（读取准确度≥99％）之间取得了很好的平衡

以下是一些研究团队如何将pacBio测序用于冠状病毒研究的方法：

1.LabCorp是美国最大的第三方检测实验室之一，在本次疫情中积极支持政府部门对COVID-19的响应，并将与pacBio保持密切合作，对大量来自疑似阳性样本中的SARS-CoV-2病毒进行测序。 LabCorp的科研团队将利用这些信息来发现不同地区病毒的突变情况，从而阐明病毒的进化，及其对疾病严重性和治疗结果的影响，从而有助于支持更好的患者治疗决策。


MarCor Eisenberg博士
LabCorp Diagnostics首席科学官

“随着我们努力尽快和尽可能多地了解这种新型冠状病毒的生物学特性，以帮助应对当前的大流行并展望未来的爆发，pacBio SMRT测序将为我们提供病原体的准确，高分辨率的视图。”

2.美国国家过敏和传染病研究所（NIAID）疫苗研究中心的科学家计划使用Sequel II系统研究从感染个体收集的样本中的病毒种群多样性和微小变异。 这些信息最终可用于支持有效疫苗和基于抗体的疗法的设计。


Anthony Fauci博士
美国国家过敏和传染病研究所所长

美国国家过敏和传染病研究所也许大家不熟悉，但是它的所长最近可是家喻户晓，他就是大名鼎鼎的Anthony Fauci（安东尼•福奇）。

3.在加利福尼亚大学圣地亚哥分校，科学家正在使用pacBio SMRT测序数据分析SARS-CoV-2样品。 他们将利用靶向测序来研究病毒基因组以及使用鸟枪法研究病毒宏基因组，以表征对COVID-19感染有反应的鼻腔微生物组。


Rob Knight 博士
加州大学圣地亚哥分校微生物组学创新中心主任

“我们预计，通过Sequel II 系统的HiFi 测序将大大提升我们对SARS-CoV-2病毒本身及其在感染人体的作用方式上的了解。”

4.在德国莱布尼兹协会的Borstel研究中心，专注于肺部疾病的科学家将对SARS-CoV-2样本和从常规诊断样本中收集到的其他肺病原体进行测序，以促进基因组诊断应用并研究其传播和进化 。

5.范德比尔特疫苗中心的研究人员已使用pacBio测序技术来研究人B细胞对SARS-CoV-2病毒的反应，目的是从患者样品中鉴定治疗性或保护性抗体。


Jonas Korlach 博士
pacBio首席科学官

“我们为能够支持迅速扩大的从事抗击COVID-19的客户群体而感到自豪，并相信pacBio SMRT测序的独特优势将助力科学家们更深入的研究病毒生物学，并直接支持当下急需的诊断测试、疫苗和抗COVID-19的药物研发。”

更多COVID-19相关信息请访问我们的COVID-19 Sequencing Resource Center，以查看最新的测序方案，引物信息和相关文献。