测序与“算命”:出生时每携带一个PTV,寿命就会缩短6个月
最近发表在eLife杂志上的一篇题为“Germline burden of rare damaging variants negatively affects human healthspan and lifespan”文章结果表明,一个额外的遗传损伤性变异可能会砍掉6个月寿命,这些罕见的突变的不同组合决定一个人多大年龄可能患上癌症、心脏病和痴呆症。
有趣的是,现在科学家发现的大多数寿命相关基因突变都在长寿者(比如百岁以上老人)身上,而其他人群携带的突变对寿命有什么影响仍不清楚。
“迄今为止发现的基因变异只能解释一小部分人类寿命相关遗传,”作者写道。“在这里,我们报告了负担人类寿命和健康的两大类蛋白质截短变体(protein-truncating variants,pTVs),每个变异分别减少0.4年和1.3年寿命。寿命更长的个体拥有更少罕见pTVs和更少破坏性pTVs。在体细胞中pTVs的积累只占死亡率和发病率加速的一小部分,因此它们不太可能参与衰老。”
研究人员指出“减少寿命和健康寿命的极端罕见破坏性突变的作用在很大程度上被忽视了,它们在不同的人身上是不同的(罕见),但组合起来对寿命的影响却大出人意料。”
文章一作、博后研究学者Anastasia Shindyapina指出,普通遗传研究只能探索常见的基因变异,我们对数万人进行测序所收集的数据使我们能够评估1/10000的DNA变异的影响。
超罕见的pTVs是已知的最具破坏性的基因变异之一,它们往往比更常见的基因变异产生的影响更大,并能显著改变体内重要蛋白质的数量和功能。pTVs的增加与精神分裂症、癫痫和自闭症等复杂疾病有关。在目前的研究中,研究小组重点研究了一个人出生时携带的pTVs数量如何影响其寿命,以及在整个生命周期累积的额外pTVs是否影响整体寿命和健康。
数据来自UK Biobank(平均年龄在50多岁的4万多个基因组),科学家发现,超罕见pTVs负担过重的人的健康寿命和寿命都很短,在一个人的基因组中,每增加一个超罕见pTVs,寿命就会缩短6个月,健康寿命就会缩短2个月。
除了与生俱来的基因变异,随着年龄的增长,我们的基因组会积累更多pTVs,但与出生时携带的相比,后来积累的影响很小。
“倘若伴随积累的突变不会加速疾病或死亡的话,为什么出生携带的会对健康寿命有影响呢?这很矛盾。”本文通讯作者peter Fedichev博士总结。“无论如何,我们的研究结果揭开了以前的遗传研究未阐明的罕见突变在衰老过程中的惊人作用。另外,我们还展示了全外显子组测序和基因组测序揭示复杂疾病遗传结构的能力。”
原文检索:Germline burden of rare damaging variants negatively affects human healthspan and lifespan
(生物通:伍松)