近年来水生生态系统受到营养过剩、污染物和全球变暖的影响,导致水体氧气浓度严重消耗。显著的缺氧会导致鱼类的死亡,但鱼类可能具有急性应激行为(例如:呼吸频率的增加,游泳频率降低)和对缺氧的生理反应(例如:氧气输送的增加和氧气消耗的减少),鱼类通过这些途径保持正常的身体活动。

为进一步了解鱼类缺氧适应的分子机制,本研究利用iTRAQ蛋白质组定量技术对缺氧条件下瓦氏黄颡鱼肝脏的蛋白质组进行了分析。对照和实验组(缺氧4小时处理)瓦氏黄颡鱼肝脏各3个生物学重复,每个样品由五个不同的个体混合而成。

本研究共鉴定出511个急性缺氧响应蛋白。通过比较几个不同关键途径(例如过氧化物酶体途径,ppAR信号通路,脂质代谢,糖酵解/糖异生和氨基酸代谢)有助于阐明参与瓦氏黄颡鱼缺氧响应过程中涉及到的不同机制。

蛋白质组学分析数据表明,瓦氏黄颡鱼可以对缺氧环境产生急性响应,包括代谢副产物的解毒和氧化应激(例如过氧化物酶体),分解代谢能力的激活以获得更多的能量(例如脂肪分解和氨基酸分解代谢),生物合成功能的抑制以减少能量消耗(例如氨基酸和脂质的生物合成),以及有氧代谢和厌氧代谢对总代谢影响的转变等。

通过研究鱼类肝脏蛋白质组在缺氧条件下发生的相关变化有助于理解肝脏或其他哺乳动物在缺氧条件下参与缺氧响应的相关分子机制。



图 研究思路流程图

参考文献
Zhang G, Zhang J, Wen X, et al. Comparative iTRAQ-based quantitative proteomic analysis of pelteobagrus vachelli liver against acute hypoxia: Implications in metabolic responses.[J]. proteomics, 2017.

本研究中iTRAQ蛋白质组学分析服务由联川生物提供

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到靶基因功能分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例,请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413

关于联川生物
联川生物成立于2006年,经过多年的快速发展,已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µparaflo®微流体定制化芯片平台,可以为科研用户提供从基因组,转录组,到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一,联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组,可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求,联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线,为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来,联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作,助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾1000篇 高水平研究论文,其中已在Cell,Nature,Science系列顶级期刊上发表论文30余篇。