New Phytol:植物病毒产生的症状到底与哪些宿主基因有关
病毒侵染会造成植株萎黄,生长迟缓,坏死或其他症状。叶绿体相关基因(ChRGs)的下调被认为与植株萎黄有关。然而尚缺乏实验证据支持这种观点。
RSV侵染本氏烟产生的症状
浙江省农业科学院陈剑平院士课题组最近在国际知名期刊《新植物学家》(New phytologist)上以“Identification and regulation of host genes related to Rice stripe virus symptom production”为题,报道了他们的最新研究成果,支持ChRGs与植株萎黄的相关性。燕飞研究员为本文的共同通讯作者。
课题组在水稻条纹病毒(RSV)侵染的本氏烟(Nicotiana benthamiana)上鉴定出一组差异表达的基因(DEGs)。研究人员采用烟草脆裂病毒(TRV)诱导基因沉默的方式逐一沉默基因,来考察75个表达下调基因对RSV症状产生的作用。
实验发现,沉默75个下调基因中的11个会造成植株萎黄,这11个中的9个基因是ChRGs(见图1)。其中沉默1个下调基因——编码真核翻译起始因子4A(eIF4A)会造成叶片扭曲和萎缩(见图2),这种现象可见于RSV侵染的本氏烟上。进一步地,研究人员发现,RSV RNA4上的一个区域与eIF4A mRNA的部分片段互补,高通量测序证实上述病毒区域来源的小干扰RNA(vsiRNAs)在病毒侵染的本氏烟上表达(图3)(高通量测序鉴定分析vsiRNA由联川协助完成)。当以人工微RNA表达vsiRNAs,它们可以靶向调控NbeIF4A mRNA。
图1 鉴定与RSV萎黄症状相关的ChRGs
图2 沉默NbeIF4A会导致叶片扭曲和萎缩
图3 RSV来源的vsiRNA具有靶向调控宿主基因NbeIF4A的潜力
上述实验证据支持ChRGs与植株萎黄的相关性,并表明eIF4A参与RSV症状的发展(图4)。本研究也是第一份报告证明,直接来自植物病毒的siRNA可以靶向调控宿主基因。
图4 RSV症状产生与宿主基因互作的模型
参考文献
Shi BB, et al. (2015) Identification and regulation of host genes related to Rice stripe virus symptom production. New phytologist. doi: 10.1111/nph.13699
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