科学家们首次实现了DNA晶体的稳定模拟
自结构生物学诞生以来,X射线晶体学一直是最广泛使用的技术,用于确定生物分子的三维结构 - 生物体中发现的化合物。在这方面,生物分子与其晶体环境之间的相互作用以及稳定晶体的分子力的知识将有助于优化该技术。
发表在Chem杂志上的一项研究- 由Cell小组制作 - 由生物医学研究所(巴塞罗那IRB)的研究人员承担,是第一个实现DNA晶体稳定模拟的研究。这一成就使科学家们能够解释实验中使用的化学添加剂在实验室中获得合适的结晶条件和稳定晶体的重要性。
“首先从这项研究中受益是生物物理学和计算物理学家/化学家,谁现在有一个基准和明确的协议,通过它来实现DNA晶体的稳定的模拟社会”巴勃罗D.丹斯,在IRB巴塞罗那博士后研究员说。
该研究由分子模拟和生物信息学实验室负责人Modesto Orozco领导,该研究提供了迄今为止DNA晶体特性的最详细的原子描述。
“从长远来看,在一系列实验条件下获得的几种晶体的模拟应该使我们能够预测和预测给定化学添加剂的效果,从而有助于指导晶体学家进行实验,并大大降低了成本和时间。获得晶体,“Modesto Orozco评论说,他的实验室是双分子计算和模拟的国际参考。
该研究得到了欧洲研究理事会(ERC)的资助,通过授予Modesto Orozco的ERC高级资助(SimDNA)和欧洲超级计算中心联盟的资助,通过第12次pRACE电话会议提供的资助,并授予这项研究的三位作者。