科学有技术可以测量单个细胞中每个基因的活动,仅仅一个实验就可以产生数千个细胞的数据。瑞典隆德大学的研究人员通过使用3D视频游戏技术,彻底改变了分析这些数据的方式。这项研究发表在杂志上iScience

先进的DNA和RNA测序技术为研究组织中的单个细胞提供了比以前更全面的方法。这些测序技术的最大挑战是它们会带来大量的数据。

隆德大学(Lund University)计算生物学研究员Shamit Soneji说:“例如,当你想要区分癌细胞和正常细胞时,你需要检查数千个细胞来获得正确的理解,这转化为大量的数字数据。”

为了使这些数据易于理解,每个细胞都被精确地放置在三维空间中,以形成细胞的“路线图”,以及它们之间的关系。然而,这些地图很难用普通的台式电脑来导航。

“能够浏览自己的数据,并直观和高效地操纵它,会给它一个全新的理解。我甚至可以说,在虚拟现实中,人们的想法会有所不同,这要归功于这项技术能让你的身体参与分析过程。”Mattias Wallerg?rd解释道。他是隆德大学交互设计和虚拟现实领域的研究人员。

隆德大学的团队开发了软件celllexalvr;一个虚拟现实环境,使研究人员能够使用直观的工具在一个地方探索他们的所有数据。通过基因活动计算出的细胞三维图和从单个细胞获取的其他信息可以被显示出来,研究者可以清楚地看到在特定细胞类型形成时哪些基因是活跃的。

使用VR头盔,用户面前有一个完整的细胞种群,可以更准确地确定细胞之间的关系。使用两个手控制器,他们可以通过简单的手势选择感兴趣的细胞进行进一步分析,就像它们是物理对象一样。

因为空间不是问题,所以在同一个“房间”中有几个细胞地图并将它们并排比较是可能的,这在传统的计算机屏幕上是很难做到的。在虚拟现实世界中,即使身处不同的地理位置,研究人员也可以聚在一起分析数据。

即使你不熟悉计算机编程,这种类型的分析对每个人都是开放的。虚拟世界是一个快速发展的研究领域,对于需要以更互动和协作的方式访问和处理大数据的科学家来说,它具有巨大的潜力。”

该软件可以在https://www.cellexalvr.med.lu.se/上免费下载