目前炎症性肠病（IBD）治疗在很大比例的病人中无效。结合体细胞和单细胞转录组学、定量组织病理学和原位定位技术对三组IBD患者（共n?=?376），我们确定了IBD中异质性组织炎症反应中共表达的基因模块，它们映射到不同的组织病理学和细胞特征（病理类型）。其中一种病理类型是由中性粒细胞高度浸润、成纤维细胞活化和深部溃疡部位的血管重塑来确定的。溃疡床中活化的成纤维细胞表现出中性粒细胞趋化特性，这是IL-1R而不是TNF依赖的。四种不同类型的中性粒细胞和非反应性的成纤维细胞增多n?=?343页）。识别不同的、局部的、组织病理类型将有助于当前治疗方法的精确靶向性，并为溃疡性疾病中IL-1信号阻断提供生物学基础。

炎症性肠病是一组以胃肠道炎症为特征的异质性疾病。病因学包括宿主与其肠道微生物群之间的适应不良，这是由遗传和环境因素控制的对话1.IBD的复杂性质反映在其临床表型上，包括克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）以及一系列显微镜特征，如肉芽肿、淋巴聚集、隐窝脓肿和溃疡2,三.IBD的治疗包括普通免疫抑制剂（如皮质类固醇）、免疫调节剂（如硫嘌呤）或生物制剂（如抗肿瘤坏死因子-α、肿瘤坏死因子-α）调节特异性炎症介质4.然而，如何确定有反应的患者仍然是一个重大挑战。