南京医科大学最新发文：RNA编辑谱的鉴定及其在肺腺癌中的临床意义
图像:LUAD患者RNA编辑亚型的鉴定。
肺腺癌(LUAD)的发病率呈逐年上升趋势，死亡率仍居高不下。LUAD基因组研究的最新进展已经确定了一些特定基因的驱动改变，从而实现了分子分类和相应的靶向治疗。然而，只有一小部分携带驱动突变的LUAD患者能从靶向治疗中获益，而剩余的大量患者未进行分类。RNA编辑事件是指RNA中核苷酸的变化。目前，RNA编辑事件在肿瘤发生中的作用及其潜在的临床应用已在一系列研究中得到报道。然而，RNA编辑事件及其在LUAD中的临床相关性在很大程度上仍然未知。
“我们通过整合NJLCC项目和TCGA项目的转录组学和基因组学数据，描述了LUAD中RNA编辑事件的全面图景。我们发现肿瘤组织中的RNA编辑水平显著增加，并且LUAD患者的RNA编辑水平具有高度异质性。肿瘤中较高的RNA编辑水平可以归因于RNA和DNA的改变。”结果表明，RNA编辑事件的模式可以反映肺腺癌的整体特征。“然后，我们根据大多数可变的RNA编辑位点，定义了一个新的分子亚型EC3。该亚型患者预后最差。重要的是，该亚型独立于基于基因表达或DNA甲基化的经典分子亚型。我们进一步提出了一个包含8个RNA编辑位点的简化预测模型，以准确区分EC3亚型。王医生说。基于少数RNA编辑位点的分子分型在临床中可能具有巨大的潜力。王博士说:“通过应用简化模型，我们发现EC3亚型与特异性化疗药物的敏感性有关。”
该研究的通讯作者沈洪兵教授说:“我们的研究全面描述了LUAD中RNA编辑的一般模式。更重要的是，我们提出了一种新的基于RNA编辑的LUAD分子分型策略，可以预测患者的预后。一种简化的模式加上一些编辑网站，使得该策略有可能在临床应用。”
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Wang, C., Huang, M., Chen, C., Li, Y., Qin, N., Ma, Z., Fan, J., Gong, L., Zeng, H., Yang, L., et al. (2021). Identification of A-to-I RNA editing profiles and their clinical relevance in lung adenocarcinoma. Sci China Life Sci 64, https:/
