对英国1000多人的SARS-CoV-2基因组多样性进行的分析表明，如果出现病毒突变，在某些情况下可以传播，但很少在后续传播中持续存在。“我们的观察表明，在宿主内出现疫苗和治疗逃避突变可能相对罕见，”作者说，“至少在病毒载量高的早期感染期间是这样。”然而，由于可以逃避抗体等疗法的突变被发现，包括在更高病毒载量的样本中，作者鼓励持续监测和警惕，特别是当疫苗和疗法对病毒施加“压力”使其适应新环境的时候。迄今为止，对SARS-CoV-2突变的大多数分析都集中于在代表显性变异的个体中观察到的突变。然而，在受感染的个体中也出现了新的突变，了解人类宿主中病毒的全部潜在多样性——它们出现的频率以及它们是否被传播——对于了解病毒适应和传播模式很重要。为了更好地描述单个人类宿主的多样性，Katrina Lythgoe及其同事利用RNA测序方法分析了1390个SARS-CoV-2基因组，这些样本主要来自英国在2020年3月至6月(第一波全球感染浪潮)期间发病的有症状患者的1313个鼻咽拭子。作者在大多数个体中只观察到一到两种变异，但少数患者携带多种变异。其中大多数在传播时就消失了，不过有少数开始了持续传播和更广泛的传播。此外，在所研究的基因组中，病毒在家庭之间传播的案例非常少。这些结果表明，在早期感染期间，能够增加病毒逃避治疗机会的突变很少出现和传播。尽管如此，作者们还是发现了能使病毒具有优势的变异，包括在高病毒载量的样本中。这表明，随着疫苗推出带来的种群选择压力的增加，自然发生的变异将有机会传播。他们说，这些发现强调了持续监测的必要性。

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